ماموریت های اصلی طب کار، پیشگیری از بیماری‌های شغلی، افزایش بهره‌وری، کاهش غیبت از کار،کاهش هزینه‌های درمانی، تطبیق کار با توانایی‌های فردی، ارزیابی سلامت کارکنان و ارائه مشاوره به کارکنان است. 

1. برنامه ریزی اجرای طرح ها و برنامه‌های بهداشت حرفه ای ابلاغ شده از مرکز سلامت محیط و کار

2. اجرای برنامه بازرسی هدفمند از واحدهای صنعتی و صنفی

3. برنامه ریزی جهت سالمسازی و کنترل عوامل زیان آور محیط کار

4. بررسی و اظهارنظر در خصوص درخواست متقاضیان مشاغل سخت و زیان آور

5. برنامه ریزی جهت انجام معاینات سلامت شغلی کارگران و پایش و نظارت بر مراکز ارائه دهنده خدمات طب کار

6. برنامه ریزی جهت ارتقای خدمات مهندسی بهداشت حرفه‌ای و سنجش عوامل زیان آور محیط کار

7. برنامه ریزی جهت ارتقاء سطح دانش فنی کارشناسان بهداشت حرفه ای شاغل در صنایع

8. رسیدگی به شکایات کارگری در خصوص بیماری های ناشی از کار و شرایط بهداشتی کارگاه های صنعتی

9. برنامه ریزی جهت پایش واحد های بهداشت حرفه ای مراکز بهداشت تابعه

10. بازرسی و نظارت بر اجرای پروتکل های بهداشت حرفه ای در بیمارستان ها، معادن، زندان و اصناف روستایی (کشاورزی، دامداری، قالیبافی)

11. نظارت بر خانه های بهداشت کارگری مستقر در صنایع

12. برنامه ریزی جهت تامین و ارتقاء سلامت عوامل اجرایی پسماند

13. برنامه ریزی جهت تدوین و اجرای طرح های پژوهشی و تحقیقاتی

 

 تمرکز بر سلامت روان، شخصی سازی خدمات گسترش حوزه فعالیت و همکاری بین بخشی بیشتر است و افزایش ارجاعات به واحد طب کار تا سقف 5000 نفر از شاغلین صنایع و کارگاه های تحت پوشش و بازرسی از صد درصد کارگاه های تحت پوشش  چشم انداز اجرای این برنامه است.